Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm3893E9Q1I1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm3893E9Q1I1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm3893E9Q1I1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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