Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt78E9Q0F0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt78E9Q0F0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt78E9Q0F0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms