Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gcom1E9PZ54 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms