Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbf2E9PXF8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbf2E9PXF8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sbf2E9PXF8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sbf2E9PXF8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sbf2E9PXF8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf2E9PXF8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms