Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sfta2E9PXB6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sfta2E9PXB6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms