Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rsf1E9PWW9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsf1E9PWW9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rsf1E9PWW9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms