Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4931408C20RikE9PWP9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
4931408C20RikE9PWP9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931408C20RikE9PWP9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms