Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3002E9PW72 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm3002E9PW72 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3002E9PW72 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms