Protein–RNA interactions for Protein: E9PW05

Zfp54, Zinc finger protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp54E9PW05 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp54E9PW05 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp54E9PW05 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms