Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttc17E9PVB5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttc17E9PVB5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms