Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.32■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.31■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.27■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1110002E22RikE0CYV9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
1110002E22RikE0CYV9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1110002E22RikE0CYV9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1110002E22RikE0CYV9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1110002E22RikE0CYV9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1110002E22RikE0CYV9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1110002E22RikE0CYV9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1110002E22RikE0CYV9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1110002E22RikE0CYV9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1110002E22RikE0CYV9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1110002E22RikE0CYV9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms