Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb3D3Z6J4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb3D3Z6J4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms