Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms