Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc6D3YZP9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc6D3YZP9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc6D3YZP9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms