Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf217D3YYI7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf217D3YYI7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms