Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BC048679D3YXE9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BC048679D3YXE9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms