Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3259D3YUK0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3259D3YUK0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3259D3YUK0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3259D3YUK0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3259D3YUK0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms