Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdzd8B9EJ80 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzd8B9EJ80 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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