Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pnldc1B2RXZ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pnldc1B2RXZ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms