Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Polr3aB2RXC6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Polr3aB2RXC6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr3aB2RXC6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms