Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm2012B1B0R1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm2012B1B0R1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2012B1B0R1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2012B1B0R1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2012B1B0R1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2012B1B0R1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2012B1B0R1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2012B1B0R1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm2012B1B0R1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm2012B1B0R1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm2012B1B0R1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms