Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scml2B1AVB3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scml2B1AVB3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scml2B1AVB3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms