Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm438B1ASB3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm438B1ASB3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm438B1ASB3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms