Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp36B1AQJ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp36B1AQJ2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms