Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Skint5A7XUY5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Skint5A7XUY5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Skint5A7XUY5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Skint5A7XUY5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms