Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint3A7TZF0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint3A7TZF0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint3A7TZF0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms