Protein–RNA interactions for Protein: A6H603

Nwd1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd1A6H603 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nwd1A6H603 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nwd1A6H603 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nwd1A6H603 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nwd1A6H603 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nwd1A6H603 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms