Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttc38A3KMP2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc38A3KMP2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc38A3KMP2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms