Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plcb2A3KGF7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plcb2A3KGF7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Plcb2A3KGF7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms