Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp8b5A3FIN4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp8b5A3FIN4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms