Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palm3A2TJV2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Palm3A2TJV2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Palm3A2TJV2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms