Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r232A2RTT5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r232A2RTT5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms