Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef25A2ASI9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef25A2ASI9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef25A2ASI9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms