Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SktA2AQ25 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SktA2AQ25 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SktA2AQ25 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms