Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tubb1A2AQ07 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb1A2AQ07 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb1A2AQ07 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms