Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcflA2APF3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtcflA2APF3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms