Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GabreA2AMW3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GabreA2AMW3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GabreA2AMW3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms