Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc183A2AJB1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc183A2AJB1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc183A2AJB1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms