Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ambra1A2AH22 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ambra1A2AH22 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ambra1A2AH22 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms