Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm11A2AGX3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm11A2AGX3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms