Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34dA2AGU5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34dA2AGU5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms