Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rbbp8nlA2ABX0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbbp8nlA2ABX0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbbp8nlA2ABX0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms