Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Shisal2aA2A9G7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Shisal2aA2A9G7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms