Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87977A2A958 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C87977A2A958 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C87977A2A958 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C87977A2A958 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C87977A2A958 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms