Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chd5A2A8L1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chd5A2A8L1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd5A2A8L1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd5A2A8L1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms