Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbf1A2A870 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbf1A2A870 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms