Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calcoco2A2A6M5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calcoco2A2A6M5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms