Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpc1lA2A5N3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpc1lA2A5N3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpc1lA2A5N3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms