Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pgap3A2A559 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgap3A2A559 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms