Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam71e1A1L3C1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam71e1A1L3C1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms